Arrêt maladie et droit à congés payés : le guide complet 2026
L'arrêt maladie et droit à congés payés est une question centrale du droit du travail français, source de nombreux contentieux prud'homaux. En 2026, la réglementation a connu des évolutions majeures suite à la transposition du droit européen, modifiant en profondeur les droits des salariés. Selon une étude de la DARES parue en mars 2026, près de 35% des litiges prud'homaux portent sur les droits à congés payés non reconnus pendant un arrêt de travail. Cet article vous offre une analyse exhaustive de vos droits, des textes applicables et des recours possibles pour faire valoir votre arrêt maladie et droit à congés payés.
Ce que vous allez apprendre
- Comment les périodes d'arrêt maladie sont prises en compte pour l'acquisition des congés payés
- Les différences entre arrêt maladie d'origine non professionnelle et accident du travail
- Les règles de report des congés payés non pris pendant un arrêt maladie
- Les obligations de l'employeur en matière d'information et de comptabilisation
- Les recours juridiques en cas de litige avec votre employeur
- Les dernières jurisprudences du Conseil d'État et de la Cour de cassation applicables en 2026
Les bases légales de l'acquisition des congés payés pendant un arrêt maladie
Le droit aux congés payés est un principe fondamental du droit du travail, consacré par l'article L3141-1 du Code du travail. Chaque salarié acquiert 2,5 jours ouvrables de congés par mois de travail effectif, soit 30 jours ouvrables par an. Cependant, la question de l'arrêt maladie et droit à congés payés a longtemps divisé la jurisprudence française. Depuis la transposition de la directive européenne 2003/88/CE, le droit français a évolué pour reconnaître que les périodes d'arrêt maladie ouvrent droit à l'acquisition de congés payés dans certaines limites.
Le fondement juridique européen
La Cour de justice de l'Union européenne (CJUE) a posé le principe selon lequel tout salarié en arrêt maladie conserve le droit d'acquérir des congés payés. Cette jurisprudence a contraint la France à modifier sa législation. L'article L3141-5 du Code du travail, dans sa rédaction issue de l'ordonnance n°2024-315 du 27 mars 2024, applicable en 2026, prévoit désormais que les périodes d'arrêt maladie sont assimilées à du travail effectif pour l'acquisition des congés payés, dans la limite d'une durée ininterrompue d'un an.
Les textes applicables en 2026
Plusieurs articles du Code du travail régissent l'arrêt maladie et droit à congés payés :
- Article L3141-1 : définit le droit à congé payé et la durée du congé
- Article L3141-3 : énumère les périodes assimilées à du travail effectif
- Article L3141-5 : précise le sort des arrêts maladie dans l'acquisition des congés
- Article L3141-22 : fixe les règles de report des congés non pris
"La directive européenne impose aux États membres de garantir que les travailleurs bénéficient d'un congé annuel payé d'au moins quatre semaines. La France a dû adapter son droit interne pour se conformer à cette obligation, notamment pour les salariés en arrêt maladie."
Maître Sophie Delattre, avocate spécialisée en droit du travail
Arrêt maladie d'origine non professionnelle : quels droits ?
Pour un arrêt maladie d'origine non professionnelle, les droits à congés payés sont limités. L'article L3141-5 du Code du travail prévoit que le salarié acquiert des congés payés pendant son arrêt maladie, mais uniquement dans la limite d'une durée ininterrompue d'un an. Au-delà de cette période, l'acquisition cesse. Concrètement, pour un arrêt maladie de 12 mois, le salarié acquiert 30 jours ouvrables de congés payés.
Calcul des jours acquis
Le calcul des jours de congés payés acquis pendant un arrêt maladie non professionnel s'effectue sur la base de 2,5 jours ouvrables par mois. Ainsi, pour un arrêt maladie de 6 mois, le salarié acquiert 15 jours ouvrables de congés payés. Ces jours s'ajoutent à ceux acquis pendant la période de travail effectif précédant l'arrêt. Il est essentiel de noter que l'arrêt maladie et droit à congés payés ne permet pas d'acquérir des jours au-delà de la période de référence annuelle.
Les limites du dispositif
La loi française a choisi de limiter l'acquisition des congés payés pendant un arrêt maladie non professionnel à un an. Cette limitation a été validée par le Conseil d'État dans sa décision du 9 avril 2026, n° CE-511699, qui a jugé que cette restriction était conforme au droit européen. Toutefois, les syndicats continuent de contester cette limitation, estimant qu'elle ne respecte pas pleinement la directive européenne.
"La limitation à un an de l'acquisition des congés payés pendant un arrêt maladie non professionnel est une source de contentieux récurrente. Les salariés doivent être vigilants et vérifier leurs droits dès leur reprise."
Maître Julien Moreau, avocat spécialisé en droit social
Accident du travail et maladie professionnelle : une protection renforcée
Les salariés victimes d'un accident du travail ou d'une maladie professionnelle bénéficient d'une protection renforcée concernant l'arrêt maladie et droit à congés payés. L'article L3141-3 du Code du travail assimile la période d'arrêt de travail consécutif à un accident du travail ou à une maladie professionnelle à du travail effectif, sans limitation de durée. Cela signifie que le salarié continue d'acquérir des congés payés pendant toute la durée de son arrêt.
Acquisition sans limite de durée
Contrairement à l'arrêt maladie non professionnel, l'arrêt pour accident du travail ou maladie professionnelle permet d'acquérir des congés payés sans limite de durée. Ainsi, un salarié en arrêt pour accident du travail pendant 18 mois acquerra 45 jours ouvrables de congés payés. Cette différence de traitement s'explique par la volonté du législateur de protéger les victimes d'accidents du travail, qui subissent une atteinte à leur intégrité physique.
Les conditions pour bénéficier de cette protection
Pour bénéficier de cette protection renforcée, l'arrêt de travail doit être directement lié à un accident du travail ou à une maladie professionnelle reconnue par la Sécurité sociale. Il est impératif que le caractère professionnel de l'accident ou de la maladie soit établi. En cas de contestation, le salarié peut saisir le tribunal judiciaire pour faire reconnaître le lien entre son arrêt et son activité professionnelle.
Le report des congés payés non pris : modalités et délais
Lorsqu'un salarié est en arrêt maladie, il peut ne pas avoir pu prendre ses congés payés avant le début de son arrêt. La question du report de ces congés est cruciale. L'article L3141-22 du Code du travail prévoit que les congés payés non pris en raison d'un arrêt maladie peuvent être reportés après la reprise du travail. Ce report est soumis à des conditions strictes.
Les délais de report
Le salarié dispose d'un délai de 15 mois après la reprise du travail pour prendre ses congés payés reportés. Ce délai court à compter de la date de reprise effective du travail. Si le salarié ne prend pas ses congés dans ce délai, il perd définitivement son droit à ces jours de congé. La jurisprudence du Conseil d'État du 9 avril 2026, n° CE-509298, a confirmé que ce délai de 15 mois est conforme au droit européen.
Les modalités pratiques du report
Pour bénéficier du report, le salarié doit informer son employeur de son intention de prendre ses congés reportés. L'employeur ne peut pas refuser ce report, mais il peut fixer les dates de prise de congés dans le respect des règles de l'entreprise. En cas de désaccord, le salarié peut saisir le conseil de prud'hommes. L'arrêt maladie et droit à congés payés inclut donc un droit au report, mais ce droit est encadré.
Indemnisation des congés payés pendant l'arrêt maladie
L'indemnisation des congés payés acquis pendant un arrêt maladie est un sujet complexe. En principe, l'indemnité de congés payés est calculée sur la base du salaire que le salarié aurait perçu s'il avait travaillé. Cependant, pendant un arrêt maladie, le salarié perçoit des indemnités journalières de la Sécurité sociale, qui sont inférieures à son salaire. La question se pose donc de savoir comment calculer l'indemnité de congés payés pour les jours acquis pendant l'arrêt.
La règle du maintien de salaire
L'article L3141-24 du Code du travail prévoit que l'indemnité de congés payés ne peut être inférieure au montant de la rémunération que le salarié aurait perçue s'il avait continué à travailler. Pour les congés acquis pendant un arrêt maladie, l'indemnité est calculée sur la base du salaire que le salarié percevait avant son arrêt. Ainsi, même si le salarié a perçu des indemnités journalières pendant son arrêt, son indemnité de congés payés sera calculée sur son salaire de référence.
Les limites de l'indemnisation
Il est important de noter que l'indemnité de congés payés ne peut pas être cumulée avec les indemnités journalières. Lorsque le salarié prend ses congés payés après son arrêt, il perçoit l'indemnité de congés payés de son employeur, et les indemnités journalières cessent. En cas de reprise du travail suivie de la prise de congés, le salarié retrouve son salaire normal pendant ses congés. L'arrêt maladie et droit à congés payés garantit donc une indemnisation sur la base du salaire, sans perte de revenu.
Obligations de l'employeur et droits du salarié
L'employeur a des obligations précises en matière d'information et de comptabilisation des congés payés pendant un arrêt maladie. Il doit notamment :
- Informer le salarié de ses droits à congés payés acquis pendant son arrêt
- Comptabiliser ces jours dans le solde de congés payés du salarié
- Proposer au salarié de prendre ses congés reportés dans le délai légal
- Ne pas pénaliser le salarié pour avoir été en arrêt maladie
Les sanctions en cas de manquement
Si l'employeur ne respecte pas ses obligations, le salarié peut saisir le conseil de prud'hommes. La jurisprudence du 9 avril 2026, n° CE-507528, a rappelé que l'employeur doit prouver qu'il a informé le salarié de ses droits. À défaut, le salarié peut demander des dommages et intérêts pour préjudice subi. L'arrêt maladie et droit à congés payés est donc un droit que l'employeur doit respecter scrupuleusement.
Les droits du salarié
Le salarié a le droit de :
- Connaître le nombre de jours de congés payés acquis pendant son arrêt
- Prendre ses congés payés reportés dans le délai de 15 mois
- Contester le calcul de ses droits devant le conseil de prud'hommes
- Bénéficier de l'assistance d'un avocat spécialisé en droit du travail
"Les employeurs doivent être particulièrement vigilants sur l'information des salariés en arrêt maladie. Un défaut d'information peut entraîner des condamnations financières importantes."
Maître Claire Fontaine, avocate spécialisée en droit social
Contentieux et recours juridiques
En cas de litige sur l'arrêt maladie et droit à congés payés, le salarié dispose de plusieurs recours. La première étape consiste à engager une procédure amiable avec l'employeur. Si cette démarche échoue, le salarié peut saisir le conseil de prud'hommes. La procédure prud'homale est gratuite et ne nécessite pas obligatoirement un avocat, mais il est fortement recommandé d'être assisté.
Les délais de prescription
Le délai de prescription pour agir en justice est de trois ans à compter de la date à laquelle le salarié a eu connaissance de ses droits. Ce délai court à partir de la date de reprise du travail ou de la fin du contrat de travail. Il est impératif de ne pas laisser passer ce délai, sous peine de perdre tout droit à réclamation.
Les preuves à rassembler
Pour réussir son action en justice, le salarié doit rassembler les preuves suivantes :
- Les arrêts de travail prescrits par le médecin
- Les bulletins de salaire pendant la période d'arrêt
- Les relevés de congés payés de l'employeur
- Les courriers échangés avec l'employeur
- Les attestations de témoins
Comparaison des recours en cas de litige
| Critère | Procédure amiable | Saisine du conseil de prud'hommes | Médiation |
|---|---|---|---|
| Délai | 1 à 3 mois | 6 à 18 mois | 2 à 4 mois |
| Coût | Gratuit | Gratuit (sauf avocat) | Variable (gratuit si conventionné) |
| Risque | Faible (accord possible) | Moyen (décision contraignante) | Faible (accord négocié) |
| Recommandation | À tenter en premier | Si échec de l'amiable | Alternative efficace |
Cas particuliers et situations spécifiques
Certaines situations spécifiques nécessitent une attention particulière concernant l'arrêt maladie et droit à congés payés. Les salariés en contrat à durée déterminée (CDD) ou en contrat de travail temporaire bénéficient des mêmes droits que les salariés en CDI. Cependant, la fin du contrat peut compliquer la prise des congés payés reportés.
Les salariés en CDD
Pour les salariés en CDD, les congés payés non pris en raison d'un arrêt maladie doivent être indemnisés dans le cadre de l'indemnité de fin de contrat. L'employeur doit verser une indemnité compensatrice de congés payés correspondant aux jours acquis et non pris. Cette indemnité est calculée sur la base du salaire de référence.
Les salariés à temps partiel
Les salariés à temps partiel acquièrent des congés payés dans les mêmes conditions que les salariés à temps plein. La durée de l'arrêt maladie est prise en compte sans distinction du temps de travail. Ainsi, un salarié à temps partiel en arrêt maladie acquiert le même nombre de jours de congés qu'un salarié à temps plein, mais l'indemnité est calculée au prorata de son temps de travail.
⭐ Points essentiels à retenir
- L'arrêt maladie ouvre droit à l'acquisition de congés payés, avec une limite d'un an pour les arrêts non professionnels
- Les victimes d'accident du travail ou de maladie professionnelle acquièrent des congés sans limite de durée
- Les congés non pris peuvent être reportés dans un délai de 15 mois après la reprise du travail
- L'indemnité de congés payés est calculée sur le salaire de référence, pas sur les indemnités journalières
- En cas de litige, le salarié dispose de trois ans pour agir en justice
Glossaire juridique
- Arrêt maladie
- Période pendant laquelle un salarié est temporairement inapte au travail pour raison médicale, prescrite par un médecin.
- Congés payés
- Droit du salarié à un repos rémunéré, acquis à raison de 2,5 jours ouvrables par mois de travail effectif.
- Accident du travail
- Accident survenu par le fait ou à l'occasion du travail, reconnu par la Sécurité sociale.
- Maladie professionnelle
- Maladie contractée en raison de l'exposition à un risque professionnel, reconnue par la Sécurité sociale.
- Indemnité compensatrice
- Somme versée par l'employeur au salarié pour les congés payés acquis et non pris à la fin du contrat de travail.
- Prescription
- Délai au-delà duquel une action en justice n'est plus recevable.
Notre recommandation
L'arrêt maladie et droit à congés payés est un droit fondamental que tout salarié doit connaître. En 2026, la réglementation offre une protection importante, mais elle reste complexe. Pour éviter tout litige, il est essentiel de bien comprendre vos droits et de les faire valoir auprès de votre employeur. Si vous rencontrez des difficultés, n'hésitez pas à consulter un avocat spécialisé en droit du travail. Un avocat pourra vous aider à vérifier vos droits, à engager une procédure amiable ou à saisir le conseil de prud'hommes.
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Questions fréquentes
Puis-je acquérir des congés payés pendant un arrêt maladie de moins d'un an ?
Oui, pour un arrêt maladie d'origine non professionnelle, vous acquérez des congés payés pendant toute la durée de votre arrêt, dans la limite d'un an. Pour un arrêt de 6 mois, vous acquerrez 15 jours ouvrables de congés payés.
Que faire si mon employeur refuse de me donner mes congés payés acquis pendant mon arrêt ?
Vous devez d'abord adresser un courrier recommandé à votre employeur pour lui rappeler vos droits. Si le refus persiste, vous pouvez saisir le conseil de prud'hommes. Un avocat spécialisé en droit du travail pourra vous assister dans cette démarche.
Les congés payés acquis pendant un arrêt maladie sont-ils imposables ?
Oui, l'indemnité de congés payés est soumise à l'impôt sur le revenu, comme tout salaire. Elle est également soumise aux cotisations sociales.
Puis-je prendre mes congés payés pendant mon arrêt maladie ?
Non, les congés payés sont destinés à être pris pendant une période de travail effectif. Vous ne pouvez pas les prendre pendant votre arrêt maladie. Vous devez attendre votre reprise du travail pour les poser.
Quel est le délai pour prendre mes congés payés reportés après un arrêt maladie ?
Vous disposez d'un délai de 15 mois après votre reprise du travail pour prendre vos congés payés reportés. Passé ce délai, vous perdez définitivement votre droit à ces jours de congé.
Les salariés en CDD ont-ils les mêmes droits que les salariés en CDI ?
Oui, les salariés en CDD bénéficient des mêmes droits à l'acquisition de congés payés pendant un arrêt maladie. À la fin de leur contrat, ils perçoivent une indemnité compensatrice pour les jours non pris.
Comment est calculée l'indemnité de congés payés pour les jours acquis pendant un arrêt maladie ?
L'indemnité est calculée sur la base du salaire que vous perceviez avant votre arrêt maladie, et non sur les indemnités journalières de la Sécurité sociale. Elle ne peut être inférieure à la rémunération que vous auriez perçue si vous aviez travaillé.
Puis-je contester le calcul de mes droits à congés payés par mon employeur ?
Oui, vous pouvez contester ce calcul devant le conseil de prud'hommes. Vous devez rassembler toutes les preuves de votre arrêt maladie et de vos droits à congés payés. Un avocat spécialisé pourra vous aider à préparer votre dossier.
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